L’église San Juan Batista sur la place dans le quartier de  Yanahuara.

Les sculpteurs indiens ont mêlé à l'iconographie chrétienne des éléments incas (pumas, Incas, fleurs et fruits du pays...). De même, dans certaines églises, ils ont représenté la Vierge visiblement enceinte (référence à la Pachamama).

A gauche de l'église, se trouve une croix avec les instruments de la passion : l'échelle pour dépendre le corps, la lance du centurion, l'éponge imbibée de vinaigre au bout de la branche d'ysope, le glaive de Saint Pierre avec l'oreille qu'il coupa à un soldat romain, la main du Grand-Prêtre qui gifla le Christ, le marteau et les tenailles

L’Église et le Complexe de la Compañia

 Cet ensemble se compose de plusieurs édifices construits par les jésuites, aussi bien à des fins religieuses que de logement. Le temple s’élève au milieu de cet ensemble. L’église de la Compañia construite en 1 573 fut détruite par un tremblement de terre en 1 584. La structure actuelle date de 1 650. Elle est de style baroque. De surprenants entrelacs de motifs végétaux, animaux et indiens (perroquets, coquillages, masques indigènes)  ornent son portail mais aussi son cloître, tandis que la nef de l’église est agrémentée de retables, finement sculptés et entièrement couverts d’or.

Comme dans la cathédrale, se trouvent le drapeau péruvien à gauche et le drapeau du Vatican, à droite. Le portrait de la Madone et l'enfant est de style maniériste.